1、組成成分不同

葡萄糖漿是從淀粉中經過一系列加工得到的，其成分含有葡萄糖、麥芽糖、和低聚糖。根據葡萄糖濃度的不同，葡萄糖漿還會有一個純度分級。一般烘焙中常見的就是普通葡萄糖漿，DE值（純度值）42的。

轉化糖漿的原材料是蔗糖，經過分解形成果糖：葡萄糖=1:1的比例。

2、產品物理、化學性質區別

葡萄糖漿一般比較清澈、濃稠，甜度相對低，烘烤時候比較難產生變色反應。

轉化糖漿一般是乳白色半固體狀態，甜度很高（蔗糖1.3倍左右），烘烤時上色很快。

3、主要用途、目的不同

葡萄糖漿：多用于制作果醬、醬料等，可以用于增加產品整體濃稠度。由于它的柔韌特性，還被大量用于生產充氣型糖果（牛軋糖、棉花糖），可以使糖果變得更加有嚼勁、柔韌性更佳。還有，因為其甜度低，體積相對大，生產中不會把葡萄糖漿代替甜味劑使用。

轉化糖漿：大多數時候的使用是部分替換甜味劑。這樣操作可以帶來很多好處，包括但不僅限于保持產品的濕潤程度、防止冷凍形成冰晶、烘烤顏色加快、避免細菌滋生等。